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一、模型用途
本模型为蛋白质二级结构(a—螺旋结构)球棍式模型。适用高、中等院校进行生化、生物教学时作直观教具。
二、示教内容及主要参数
1、本模型是放大三亿倍,由八个肽键平面盘绕成的3.613右手a—螺旋体构象。
2、肽键以每3.6个氨基酸残基为一周。
3、主链上的羰基(C=O)与亚胺基(﹥N—H)形成氢键。氢键之间间隔三个氨基酸残基,即第一个肽键平面上的H和第四个肽键平面上的O形成氢键,其间共有13个原子。
4、各原子的符号及颜色、规格。(见下图)
三、使用方法
1、氢键可以拆开重组合,以形成不同的构象。
2、用伸展的肽链表示β折叠等
3、重新装成α螺旋时,八个肽键平面一定要盘绕成右
手螺旋,切勿错绕成左手螺旋。
4、模型上端为氨基末端,下端为羰末端。上端H原子上三根短的红棍,表示被横截断的氢键。肽键平面中央红色条子表示肽键。
附表:各原子的符号、颜色、规格。
序号 |
名称 |
符号 |
键角 |
尺寸mm |
颜色 |
形状 |
1 |
α—碳原子 |
|
1090 |
直径25 |
黑 |
球 |
2 |
碳原子 |
﹥C= |
1200 |
|||
3 |
氢原子 |
H— |
|
直径20 |
橙 |
|
4 |
氧原子 |
O= |
|
直径25 |
天蓝 |
|
5 |
氮原子 |
|
1200 |
直径25 |
深蓝 |
|
|
侧链 |
R— |
|
直径30 |
浅蓝 |
|
|
氢键 |
|
|
H—O之间长60 |
橙 |
棍 |
|
键 |
|
|
C—O间长12 C—Ca间长21 C—N长15 H—Ca长19 N—H长8 |
红 |
|
|
肽键平面 |
无色透明:平板 |